บางทีการใช้อีเมลบริษัทนั้นก็ย่อมมีอีเมลที่สำคัญส่งเข้ามาเช่น อีเมลที่ติดต่อกับลูกค้า หรือ การทำข้อตกลงต่าง ๆ เป็นต้น และถ้าหากอีเมลดังกล่าวนั้นส่งเข้ามาแล้วแต่ไม่มีการแจ้งเตือนบอกให้ทราบ อาจจะทำให้เกิดความเสียหายตามมาได้ ฉนั้นการตั้งค่าการแจ้งเตือนใน Thunderbird สำหรับอีเมล์ใหม่ที่ส่งเข้ามา สามารถทำได้ตามขั้นตอนดังนี้
เปิดโปรแกรม Thunderbird ขึ้นมา
เลือกเ “Setting” 
ในหัวข้อ “General” เลื่อนมาที่หัวข้อ “Incoming Mails”
ตั้งค่าเสียงเตือนเมื่อมีอีเมล์ใหม่เข้ามา โดยเลือก “Play a sound” และเลือกไฟล์เสียงที่ต้องการใช้งาน
หลังจากตั้งค่าดังกล่าวแล้ว โปรแกรม Thunderbird จะแสดงเสียงและหน้าต่างแจ้งเตือนเมื่อมีอีเมลใหม่เข้ามาในกล่องของคุณ ซึ่งจะช่วยให้คุณไม่พลาดการตอบกลับอีเมลที่สำคัญ และอำนวยความสะดวกในการใช้งานอีเมลบริษัทของคุณได้มากยิ่งขึ้น